武夷山市第二医院成立于2005年，是市卫生局直接领导的一家以高标准服务为起点，高科技医疗项目为重点，集预防、保健、医疗、康复、健康教育、计划生育技术指导、社区卫生服务为一体的现代化综合性医疗机构。
医院秉承“科技兴院，以人为本的建院方针，广纳各种优秀人才，构成了合理的高素质人才梯队。各科室以副高职称以上的学科带头人为主，具有深厚扎实的理论功底和丰富的临床经验。医院还不定期邀请省内三甲医院及全国各大医院著名专家教授来院会诊和学术交流，竭诚为武夷山人民健康保驾护航。
医院依照以“特色专科为主导”以“大专科，小综合”的办院思想，创造一流的现代化综合性医院的发展模式，设立有：内科、儿科、外科、碎石科、乳腺外科、泌尿科、男科、前列腺炎科、妇产科、妇科、不孕不育科、无痛人流中心、皮肤科、耳鼻喉科、肛肠科、颈肩腰腿痛科、胃肠科、骨伤科、肝病科、计划生育科、中医科、亚健康体检科、等数十个科室，其中妇产科、妇科、外科、乳腺外科、泌尿男科、肛肠科享有盛誉。
巨资引进一系列代表国内外先进水平的医疗检测设备和诊断系统，为临床提供了科学诊断基础。美国瓦里安乳腺钼靶机、美国GE彩超、电磁冲击波碎石机、国际领先TCT宫颈癌检查系统、德国数码宫腔镜、美国全自动生化分析仪，全数字B超诊断仪，全数字阴超诊断仪、母亲胎儿监护仪、辐射式新生儿抢救台、新生儿培养箱、多参数心电监护仪，多普勒胎心监护仪、全电脑微波治疗仪、全电脑三维牵引床、口腔综合治疗机、全自动尿液分析仪，全自动血球分析仪、全自动血凝分析仪、自动酶标检测仪、耳鼻喉治疗仪、全自动高速洗片机、美国妇科LEEP刀、数码电子阴道镜、妇科红光治疗仪、盆腔治疗仪、全电脑不孕不育检测、治疗仪，超导可视无痛人流系统、男性性功能康复仪、前列腺治疗仪、精子自动分析仪、全电脑肛肠治疗仪，日本奥林巴斯显微镜、自动化学发光分析仪、高频X光机、多功能麻醉机等百余套高、精、尖设备。使医院的临床诊断治疗和医学研究水平与国际同步。