福建九仁堂医药有限公司成立于2005年5月，地处国道边，交通便利，拥有3500㎡的库区，公司主要经营国产、进口化学药制剂、抗生素制剂、生化药品制剂、血液制品、中草药、中成药、中药饮片、化学原料药、医疗器械、化学试剂保健食品等，品种规格达1万多种，2008年销售额近亿元。公司现有5个专业业务部门，即：西药批发部、中药批发部、新特药开发部、医疗器械部、配送业务部。
2010年福建省医药有限责任公司入股原福建九仁堂医药有限公司，公司类型变更为有限责任公司（国有控股）